Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1bQ7TSF1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms