Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prrc2bQ7TPM1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms