Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd1l2Q7TN88 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms