Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smap2Q7TN29 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms