Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TwistnbQ78WZ7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TwistnbQ78WZ7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TwistnbQ78WZ7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TwistnbQ78WZ7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TwistnbQ78WZ7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TwistnbQ78WZ7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TwistnbQ78WZ7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TwistnbQ78WZ7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TwistnbQ78WZ7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TwistnbQ78WZ7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TwistnbQ78WZ7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TwistnbQ78WZ7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TwistnbQ78WZ7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TwistnbQ78WZ7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TwistnbQ78WZ7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TwistnbQ78WZ7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TwistnbQ78WZ7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TwistnbQ78WZ7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TwistnbQ78WZ7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms