Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sned1Q70E20 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms