Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpv1Q704Y3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpv1Q704Y3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpv1Q704Y3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpv1Q704Y3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpv1Q704Y3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpv1Q704Y3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpv1Q704Y3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpv1Q704Y3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpv1Q704Y3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpv1Q704Y3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms