Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl35Q6ZWV7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms