Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NinlQ6ZQ12 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NinlQ6ZQ12 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms