Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm3bQ6ZPY7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm3bQ6ZPY7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms