Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc44a1Q6X893 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms