Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc88cQ6VGS5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc88cQ6VGS5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc88cQ6VGS5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc88cQ6VGS5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc88cQ6VGS5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc88cQ6VGS5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc88cQ6VGS5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc88cQ6VGS5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc88cQ6VGS5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc88cQ6VGS5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc88cQ6VGS5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms