Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9c1Q6UJY2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9c1Q6UJY2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms