Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bnip1Q6QD59 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bnip1Q6QD59 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bnip1Q6QD59 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bnip1Q6QD59 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bnip1Q6QD59 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bnip1Q6QD59 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bnip1Q6QD59 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bnip1Q6QD59 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms