Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sort1Q6PHU5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms