Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf4Q6PFF0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms