Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup98Q6PFD9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms