Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a1Q6PEM8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc46a1Q6PEM8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc46a1Q6PEM8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc46a1Q6PEM8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc46a1Q6PEM8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc46a1Q6PEM8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms