Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf1cQ6PDZ2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms