Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc36Q6PDM4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms