Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI6

Mindy2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-2, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy2Q6PDI6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mindy2Q6PDI6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mindy2Q6PDI6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms