Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SvoplQ6PDF3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms