Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttbk1Q6PCN3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttbk1Q6PCN3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttbk1Q6PCN3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttbk1Q6PCN3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttbk1Q6PCN3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttbk1Q6PCN3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttbk1Q6PCN3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttbk1Q6PCN3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttbk1Q6PCN3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttbk1Q6PCN3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttbk1Q6PCN3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttbk1Q6PCN3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms