Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms