Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp2d40Q6P8N9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp2d40Q6P8N9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms