Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnpQ6P8I4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PcnpQ6P8I4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PcnpQ6P8I4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnpQ6P8I4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnpQ6P8I4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnpQ6P8I4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnpQ6P8I4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnpQ6P8I4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnpQ6P8I4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnpQ6P8I4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms