Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kdm2bQ6P1G2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm2bQ6P1G2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms