Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rprd2Q6NXI6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rprd2Q6NXI6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms