Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf6Q6NVF9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf6Q6NVF9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms