Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pdcd11Q6NS46 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pdcd11Q6NS46 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms