Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt40Q6IFX3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Krt40Q6IFX3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt40Q6IFX3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms