Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Smarca2Q6DIC0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms