Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo27Q6DIA9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo27Q6DIA9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms