Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFY8

Brinp2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp2Q6DFY8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brinp2Q6DFY8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brinp2Q6DFY8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brinp2Q6DFY8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brinp2Q6DFY8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brinp2Q6DFY8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brinp2Q6DFY8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brinp2Q6DFY8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brinp2Q6DFY8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms