Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rftn1Q6A0D4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms