Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msl2Q69ZF8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms