Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp4Q68FH0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms