Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SrmQ64674 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrmQ64674 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SrmQ64674 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmQ64674 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmQ64674 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SrmQ64674 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SrmQ64674 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmQ64674 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SrmQ64674 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrmQ64674 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrmQ64674 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SrmQ64674 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SrmQ64674 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SrmQ64674 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SrmQ64674 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmQ64674 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmQ64674 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmQ64674 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmQ64674 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmQ64674 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmQ64674 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmQ64674 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmQ64674 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmQ64674 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmQ64674 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmQ64674 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmQ64674 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SrmQ64674 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms