Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Top2bQ64511 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Top2bQ64511 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Top2bQ64511 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms