Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja3Q64448 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms