Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ca4Q64444 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ca4Q64444 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ca4Q64444 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ca4Q64444 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ca4Q64444 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ca4Q64444 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ca4Q64444 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ca4Q64444 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ca4Q64444 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ca4Q64444 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ca4Q64444 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ca4Q64444 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ca4Q64444 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ca4Q64444 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ca4Q64444 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms