Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zic2Q62520 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms