Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vil1Q62468 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vil1Q62468 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms