Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp4Q62445 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms