Protein–RNA interactions for Protein: Q62398

Cnga2, Cyclic nucleotide-gated olfactory channel, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga2Q62398 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga2Q62398 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga2Q62398 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga2Q62398 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga2Q62398 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga2Q62398 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms