Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff3Q62395 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tff3Q62395 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms