Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Supt6hQ62383 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms