Protein–RNA interactions for Protein: Q62376

Snrnp70, U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp70Q62376 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snrnp70Q62376 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrnp70Q62376 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms