Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrhQ62361 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrhQ62361 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrhQ62361 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TrhQ62361 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TrhQ62361 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrhQ62361 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrhQ62361 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrhQ62361 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TrhQ62361 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrhQ62361 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrhQ62361 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms