Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Ttf1Q62187 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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